广州烈冰科技空间转录组技术支持

生命科学研究的目的之一就是为了解决细胞和组织以及该组织如何影响功能这一难题。测序技术可提供特定条件下某些 组织中基因的表达信息，不仅可以推断出相应未知基因的功能，揭示特定调节基因的作用机制，而且可以辨别细胞的类型和异质性，为疾病诊断提供理论依据。但由于研究的深入或具体研究方向和内容的不同，传统的转录组测序技术显然不能够满足科研工作者们强烈的好奇心，更加直观地反映组织中基因的表达情况，随即单细胞转录组测序（Single-cell RNA-sequencing，scRNA-seq）、空间转录组（Spatial transcriptomics，ST）测序等一系列技术应运而生。烈冰生物为您提供一站式全流程空间转录组测序服务。广州烈冰科技空间转录组技术支持

烈冰科技作为国内同时拥有10XGenomics和BDRhapsody双分选平台的测序服务商及云计算服务供应商，经过多年实战，拥有丰富的单细胞悬液制备和分选经验，实测BDRhapsody对能够高效捕获粒细胞。针对不同的分选平台、建库方法，实战总结搭建出不同的数据预处理工作流程；烈冰科技NovelBrain®生物大数据平台能有效支撑生命科学研究、医疗健康等领域对大数据分析的需求。完备的高通量测序实验平台，包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC数字切片扫描仪等，配合一支来自海内外名校、多学科交叉型的高素质综合团队，为您的科学研究保驾护航。济南上海烈冰生物空间转录组技术支持空间转录组测序，上海烈冰生物科技很靠谱。

空间转录组测序在病理学中，通过添加基因表达维度，得出形态学结论，通过观察基因表达区域，了解可能发生假阴性/假阳性的位置; 在免疫学，研究免疫细胞浸润、不同区域的免疫细胞中的基因表达特征；免疫群体扩散、不同类型免疫细胞的空间位置解析； 在神经科学，研究大脑皮层层状组织解析，揭示大脑皮层的结构-功能关系，正常vs.疾病大脑结构特征分析与疾病相关的基因表达于特定的大脑皮层； 在发育生物学，通过解析每个发育阶段不同解剖区域特有的基因表达特征，解析组织中与形态形成相关基因；丰富基因表达的空间注释信息，创建组织发育的空间细胞图谱。

10XVisium的实验主要分为两部分：组织学板块和组学板块。组织学板块包括样品的包埋、切片、固定、染色及成像，记录切片的形态学信息；组学板块包括cDNA的合成、扩增、接头连接和测序，记录切片的转录本信息和空间位置信息。具体实验流程如下：A、切片制备和优化：取新鲜组织、冷冻、切片，并进行HE染色成像，优化确定切片是否覆盖靶向区域。B、切片固定和透化：将组织切片放置在含有与RNA结合捕获探针的载玻片上，并进行固定和透化，使细胞中的mRNA得到释放，并结合到相应的捕获探针上，从而获取基因表达信息。C、逆转和文库构建：以捕获的RNA为模板，进行cDNA合成，和测序文库制备。D、高通量上机测序：对制备好的测序文库，进行二代高通量短读长测序。E、数据可视化分析：结合HE结果，确定哪些基因有表达，表达量高低，以及这些基因的空间位置信息空间转录组测序技术提供了空间转录组水平下的科学研究视角。

空间转录组数据可以用单细胞转录组数据的分析策略进行分析，例如，利用GO和Pathway分析筛选不同发育时期特定空间区域内的信号通路及其关键基因的较大情况，揭示在特定发育时期特定区域内发生的生物学过程。针对任何一个基因，空间转录组可以显示表达该基因的点阵及其空间排布；单细胞转录组可以给出该基因表达的细胞类群；原位测序可以给出该基因在细胞内的表达状况。通过不同发育时间点的信息比较，可以分析细胞类群在某个部位在不同时间点的差异，给出其在细胞内的真实的演变状况。丰富的测序和数据分析经验，烈冰配套全程个性化、定制化地数据分析服务。无锡scRNA空间转录组商业化服务

空间转录组测序是高通量测序下的又一重大技术突破。广州烈冰科技空间转录组技术支持

解决空间转录组测序数据分析中由于超大数据量、超高的质控要求以及繁多分析需求而引起的分析困难，做到快速可定制化完成空间转录组分析；拥有行业先进的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的数字切片扫描仪，可以同时实现明场与荧光场下冷冻切片的快速扫描成像；Z-Stack多层聚焦扫描及Extended Focus 景深扩展多层融合扫描模式，进一步提升分辨率和清晰度，保证切片高分辨的数字图像信息精细采集；能够满足针对分析结果中感兴趣基因的RNA-FISH验证以及组织切片的免疫组化的高清成像，获取表达与定位信息。广州烈冰科技空间转录组技术支持

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